Kòm viris Fwi Tomato Brown Rugose enfekte plant tomat ak pwav atravè mond lan, konpayi grenn yo ap travay sou elvaj yon tomat rezistan.
Resous jenetik ak jenomik rich te disponib pou éleveurs tomat yo menm anvan kòmansman pwojè sekans jenomik tomat yo. Gwo koleksyon jèmplasm tomat yo te etabli depi lontan nan plizyè kote. Plis pase 75,000 asansyon tomat yo konsève nan bank jèn atravè mond lan. Youn nan pi gwo a se USDA Genebank nan Geneva, NY.
Sekans nan genòm tomat la te inisye an 2005 kòm yon efò miltinasyonal ant 14 peyi epi li te fini an 2012. Efò sa yo te akselere anpil ak aplikasyon entèlijans atifisyèl, aprantisaj machin ak algoritm avanse pou analize gwo kantite done jenetik ak fenotipik.
Tomat Pan-Genome
Chèchè ki soti nan Boyce Thompson Institute an 2020 te kreye yon genòm referans bon jan kalite pou tomat sovaj pou pwodui yon pan-genom tomat ki pi konplè epi itil. Yo te dekouvri seksyon nan genòm nan ki kache gou fwi, gwosè ak matrité, tolerans estrès ak rezistans maladi. Mèsi an pati a teknoloji sekans dènye kri ki ka li moso trè long nan ADN, genòm referans lan pi konplè ak egzak pase baz done ki egziste deja.
Teknoloji sekans ki pi ansyen yo ki li moso ki pi kout nan ADN idantifye mitasyon nan nivo yon sèl baz. Sepandan, yo pa bon nan jwenn varyant estriktirèl tankou ensèsyon, sipresyon, envèrsyon oswa repetisyon nan gwo fragman ADN.
Nan 2019, yon gwoup chèchè entènasyonal te konstwi yon pan-genom tomat lè l sèvi avèk sekans genòm ki soti nan 725 varyete filogenetik ak jewografik reprezantan. Baz done sa a gen ladan 4,873 jèn yo pa jwenn nan genòm referans orijinal la. Analiz varyasyon prezan / absan te revele pèt jèn sibstansyèl ak seleksyon negatif entans jèn ak pwomotè pandan domestikasyon tomat ak amelyorasyon.
Li atik la konplè sou www.seedworld.com.