Tou de moun ak tomat vini nan diferan fòm ak gwosè. Se paske chak moun gen yon seri inik nan varyasyon jenetik-mitasyon-ki afekte ki jan jèn yo aji ak fonksyone. Te ajoute ansanm, dè milyon de ti varyasyon jenetik fè li difisil pou predi kijan yon mitasyon patikilye ap gen konsekans sou nenpòt moun. Pwofesè Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) ak Howard Hughes Envestigatè Enstiti Medikal Zach Lippman te montre kouman varyasyon jenetik nan tomat ka enfliyanse fason yon mitasyon espesifik afekte plant lan. Li ap travay nan direksyon ke yo te kapab predi efè mitasyon sou varyete tomat diferan.
Konbinezon diferan nan mitasyon ka afekte gwosè a nan tomat enprevizib. Nan imaj sa a, premye kolòn nan montre yon tomat ki pa modifye (WT). Dezyèm ak twazyèm kolòn yo montre tomat ak yon mitasyon sèl nan yon rejyon nan pwomotè a (R1 oswa R4) pou gwosè fwi jèn SlCV3. Mitasyon endividyèl yo gen ti efè sou gwosè fwi yo. Men, konbinezon de de mitasyon sa yo (R1 + R4) bay yon fwi pi gwo.
Nan etid sa a, Lippman ak ekip li a te itilize CRISPR, yon zouti koreksyon trè egzat ak vize jèn, sou de jèn tomat ki kontwole gwosè fwi, SlCV3 ak SlWUS. Yo pwodwi plis pase 60 mutan tomat pa retire ti moso ADN nan rejyon pwomotè yo, zòn ki tou pre jèn ki kontwole ekspresyon yo. Nan kèk ka, mitasyon endividyèl ogmante gwosè a nan tomat yo pa yon ti kras. Kèk pè mitasyon pa chanje gwosè fwi ditou. Yon konbinezon kèk sinèrjetik lakòz yon dramatik, ogmantasyon sanzatann nan gwosè fwi. Lippman di: "vrè Graal Sentespri a nan tout bagay sa yo pou elvaj rekòt se previzibilite. Si mwen mutation sekans sa a, mwen pral jwenn efè sa a. Paske gen lanmè sa a nan lòt variantes ke nati te akimile ki tou pre mitasyon an ke ou se jeni, osi byen ke gaye nan tout genomic la, anpil nan yo ki ta ka enfliyanse mitasyon an espesifik ke w ap kreye. "
Sa a ranje nan entèraksyon pou nenpòt ki de mitasyon modèl konsekans yo nan yon mitasyon sèl ki fèt nan diferan orijin jenetik. Efè a se konparab ak sa yo te jwenn nan kèk maladi imen, kote kèk moun ta ka gen sèten mitasyon pre-egziste ki pwoteje yo kont maladi ki lakòz mitasyon.
Lippman ak ekip li a ap kontinye quantifier ki jan mitasyon endividyèl ak konbine afekte sèten karakteristik rekòt. Se konsa, lwen, yo te mezire entèraksyon ant de mitasyon endividyèl, men genom gen dè milyon de varyasyon. Lippman espere etidye ase entèraksyon mezirab pou fè elvaj pi previzib ak efikas.
Pou plis enfòmasyon:
Fwad Prentan Harbour laboratwa
www.cshl.edu